- BrainTools - https://www.braintools.ru -

Apple показала AI-модель для предсказания структуры белков SimpleFold

Apple показала AI-модель для предсказания структуры белков SimpleFold - 1

Apple неожиданно ворвалась в биотех с собственной AI-моделью для предсказания структуры белков — SimpleFold. До сих пор абсолютным лидером в этой области считалась AlphaFold от Google DeepMind, но у неё есть серьёзный недостаток — колоссальные требования к вычислительным ресурсам. SimpleFold делает ставку на лёгкость. Её архитектура напоминает методы из мира генерации картинок и 3D-моделей, что делает её куда более эффективной.

Примеры предсказаний SimpleFold для целей: (a) цепь A белка 7QSW (крупная субъединица RuBisCO) и (b) цепь A белка 8DAY (диметиламмилилтриптофан-синтаза 1), где истинная структура показана светло-аквамариновым цветом, а предсказание — темно-бирюзовым. (c) Сгенерированные ансамбли для целевой цепи B белка 6NDW (белок крючка жгутика FlgE) с SimpleFold, дообученным на данных МД-ансамблей. (d) Производительность SimpleFold на CASP14 при увеличении размера модели от 100 млн до 3 млрд параметров. (e) Время инференса моделей SimpleFold разных размеров на потребительском железе, например MacBook Pro M2 Max 64 ГБ.

Примеры предсказаний SimpleFold для целей: (a) цепь A белка 7QSW (крупная субъединица RuBisCO) и (b) цепь A белка 8DAY (диметиламмилилтриптофан-синтаза 1), где истинная структура показана светло-аквамариновым цветом, а предсказание — темно-бирюзовым. (c) Сгенерированные ансамбли для целевой цепи B белка 6NDW (белок крючка жгутика FlgE) с SimpleFold, дообученным на данных МД-ансамблей. (d) Производительность SimpleFold на CASP14 при увеличении размера модели от 100 млн до 3 млрд параметров. (e) Время инференса моделей SimpleFold разных размеров на потребительском железе, например MacBook Pro M2 Max 64 ГБ.

Ключевая версия SimpleFold-3B уже показала впечатляющие результаты: она достигает 95% производительности AlphaFold2, но при этом работает в 22 раза быстрее и дешевле. Для исследователей это может стать настоящим прорывом. Теперь анализ сложных белковых структур может перейти из категории «дорого и долго» в «массово и доступно».

Обзор архитектуры SimpleFold, построенной на стандартном универсальном блоке Transformer с адаптивными слоями. Кодировщик атомов, «ствол» по остаткам и декодировщик атомов используют один и тот же универсальный строительный блок. Модель обходится без парных представлений и треугольных обновлений.

Обзор архитектуры SimpleFold, построенной на стандартном универсальном блоке Transformer с адаптивными слоями. Кодировщик атомов, «ствол» по остаткам и декодировщик атомов используют один и тот же универсальный строительный блок. Модель обходится без парных представлений и треугольных обновлений.

Apple подчёркивает, что SimpleFold — лишь первый шаг в этом направлении. Но даже сейчас технология обещает ускорить открытия в медицине, фармакологии и материаловедении. Более дешёвые и быстрые предсказания белковых структур могут открыть дорогу к разработке новых лекарств, созданию устойчивых биоматериалов и даже к персонализированной медицине.

По сути, Apple бросает вызов Google на одном из самых стратегически важных направлений применения ИИ. И если AlphaFold стал революцией в своё время, то SimpleFold может стать революцией «второго уровня» — не менее точной, но куда более массовой и практичной.


Делегируйте часть рутинных задач вместе с BotHub! [1] Для доступа к сервису не требуется VPN и можно использовать российскую карту. По ссылке [2] вы можете получить 100 000 бесплатных токенов для первых задач и приступить к работе с нейросетями прямо сейчас!

Источник [3]

Автор: cognitronn

Источник [4]


Сайт-источник BrainTools: https://www.braintools.ru

Путь до страницы источника: https://www.braintools.ru/article/19942

URLs in this post:

[1] BotHub!: https://bothub.chat/?utm%5C%5C%5C%5C%5C%5C%5C%5C%5C%5C%5C%5C%5C_source=contentmarketing&utm%5C%5C%5C%5C%5C%5C%5C%5C%5C%5C%5C%5C%5C_medium=habr&utm%5C%5C%5C%5C%5C%5C%5C%5C%5C%5C%5C%5C%5C_campaign=news&utm%5C%5C%5C%5C%5C%5C%5C%5C%5C%5C%5C%5C%5C_content=APPLE%20UNVEILS%20SIMPLEFOLD%20AI%20MODEL%20FOR%20PROTEIN%20STRUCTURE%20PREDICTION

[2] По ссылке: https://bothub.chat/?invitedBy=m_aGCkuyTgqllHCK0dUc7

[3] Источник: https://arxiv.org/abs/2509.18480v1

[4] Источник: https://habr.com/ru/companies/bothub/news/950672/?utm_source=habrahabr&utm_medium=rss&utm_campaign=950672

www.BrainTools.ru

Rambler's Top100