Биологический квайн: программа из 75 букв ДНК, которая копирует сама себя
Зачем я вообще полез в ДНКПервое — это интерес, как двигатель узнать что-то новое. Это также напрямую связано с развитием ИИ, где я принимаю непосредственное участие.И второе — если посмотреть, как реальная клетка читает мРНК и собирает белки, это похоже на исполнение байткода:Рибосома движется по мРНК в одном направлении и читает её триплетами — по три нуклеотида за раз. Для программиста это похоже на последовательный разбор потока, где каждый следующий токен имеет фиксированную длину.Старт-кодон
GPT-Rosalind от OpenAI: где заканчивается хайп и начинается рабочий инструмент для биологии
Когда я писала про mRNAid, меня не отпускала одна мысль: в разработке терапевтических мРНК все еще слишком много ручной работы.Транскрипт должен и хорошо транслироваться, и достаточно долго жить, и при этом не запускать лишний иммунный ответ. На бумаге звучит красиво, а в лабораторной реальности это горы правок, локальные скрипты и “знание из головы”, которое трудно передать между командами.
Эволюция человека резко ускорилась после начала земледелия
Считалось, что культура стала нашим надежным щитом от естественного отбора. Но 15 тысяч древних геномов доказывают обратное: когда мы распахали поля и построили города, наша ДНК включилась в яростную гонку на выживание.
Роль соматических мутаций в развитии аутоиммунных заболеваний: путь к избирательной терапии
В основе аутоиммунных заболеваний щитовидной железы лежит поликлональный механизм. Соматические мутации в иммуннорегуляторных локусах ставят под сомнение традиционные подходы к лечению.Иммунная система постоянно балансирует: она должна уничтожать чужеродные агенты, но при этом не атаковать собственные ткани организма. Иммунная толерантность обеспечивается регуляторными факторами, которые предотвращают активацию лимфоцитов против аутоантигенов.
От отчаяния к мРНК: как владелец собаки полез в биотех с помощью ИИ
Спойлер: как это часто бывает, громкие заголовки оказались ближе к кликбейту, чем к суровой реальности.Но мне, как человеку с ветеринарным бэкграундом и текущей работой в биотехе, стало любопытно: что там на самом деле произошло — и как скоро к моим бывшим одногруппникам начнут приходить владельцы с флешкой геномных данных их котёнка.Итак, сама история.
Почему ИИ в биологии — риск системных галлюцинаций?
Почему в биологических проектах уверенность нейронок часто опережает реальное научное понимание, и какие выводы из этого стоит сделать разработчикам.Главный триумф AI в биологии - AlphaFold. Проект не возник из ниоткуда, он опирается на Protein Data Bank PDB
Биологи смоделировали полный жизненный цикл живой клетки
Группа исследователей впервые смоделировала полный жизненный цикл живой бактериальной клетки с наномасштабным разрешением, отследив поведение каждого гена, белка и химической реакции от репликации ДНК до клеточного деления. Результаты исследования, опубликованные в журнале Cell, открывают возможность заменить сотни реальных лабораторных экспериментов одной комплексной 4D-симуляцией.Смоделированная клетка на ранних стадиях деления
Как магистратура по искусственному интеллекту научила меня лучше понимать котиков
Статья приурочена ко Всемирному дню кошекЛюбимые Дамбо, Шпунтик и Скай, написанные рукой моей лучшей подруги
На IV Форуме будущих технологий обсудили нацпроект по биоэкономике: от «стоимости калории» до фотонных сопроцессоров
25 февраля в Москве стартовал IV Форум будущих технологий. В этом году центральной темой стала биоэкономика как системное направление экономики, которое должно объединить генетику, химию, агротех, энергетику, вычисления и промышленность в единую архитектуру.Газпромбанк на IV Форуме будущих технологий представил прикладные решения, которые уже сегодня способны менять экономику агро-, химической и энергетической отраслей.
Data-driven корова: как мы строим SaaS для геномной селекции и решаем проблемы «грязных» данных в агротехе
Вам когда-нибудь казалось, что современное ИТ — это в основном про перекладывание JSON-ов, покраску кнопок и борьбу за миллисекунды в банковских транзакциях? Недавно я наткнулся на статистику о том, сколько данных генерирует одна современная молочная ферма, и как я удивился, когда понял: большинство этих данных оседает в разрозненных Excel-таблицах, тетрадках зоотехников или, в лучшем случае, в древних локальных базах типа «СЕЛЭКС», которые не обновлялись годами.
